El día 4 de julio de 1990, Alirio de Jesús Pedraza Becerra fue detenido arbitrariamente y desaparecido por un grupo de 8 hombres vestidos de civil y fuertemente armados, en momentos que Alirio salía de la panadería San Pablo, en el Centro Comercial La Campiña, calle 145 con carrera 92, cerca a su residencia en la ciudad de Bogotá. Según testigos los hombres se identificaron con carnets de la POLICIA JUDICIAL. Alirio había sido víctima de persecuciones reiteradas por parte de los organismos militares y de Seguridad del Estado.

El compromiso que Alirio de Jesús Pedraza tenía con la defensa de los derechos humanos y su posición progresista frente a la grave crisis por la que ha pasado y sigue pasando la sociedad colombiana, se convirtieron en motivo suficiente para poner en peligro su vida y su integridad personal.